Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLGNO14967 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLGNO14967 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLGNO14967 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLGNO14967 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLGNO14967 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLGNO14967 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLGNO14967 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLGNO14967 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLGNO14967 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLGNO14967 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLGNO14967 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLGNO14967 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLGNO14967 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLGNO14967 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CLGNO14967 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLGNO14967 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLGNO14967 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLGNO14967 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLGNO14967 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CLGNO14967 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLGNO14967 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLGNO14967 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLGNO14967 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLGNO14967 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLGNO14967 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLGNO14967 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLGNO14967 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLGNO14967 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLGNO14967 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLGNO14967 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CLGNO14967 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLGNO14967 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLGNO14967 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CLGNO14967 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLGNO14967 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLGNO14967 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLGNO14967 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CLGNO14967 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLGNO14967 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLGNO14967 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLGNO14967 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLGNO14967 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLGNO14967 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLGNO14967 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLGNO14967 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLGNO14967 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLGNO14967 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLGNO14967 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLGNO14967 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLGNO14967 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLGNO14967 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLGNO14967 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLGNO14967 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLGNO14967 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLGNO14967 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLGNO14967 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLGNO14967 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLGNO14967 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLGNO14967 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLGNO14967 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLGNO14967 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLGNO14967 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLGNO14967 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLGNO14967 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLGNO14967 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLGNO14967 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLGNO14967 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLGNO14967 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CLGNO14967 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CLGNO14967 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLGNO14967 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLGNO14967 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLGNO14967 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLGNO14967 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLGNO14967 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLGNO14967 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLGNO14967 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLGNO14967 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLGNO14967 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLGNO14967 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLGNO14967 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLGNO14967 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLGNO14967 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLGNO14967 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLGNO14967 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLGNO14967 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLGNO14967 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLGNO14967 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLGNO14967 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLGNO14967 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLGNO14967 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLGNO14967 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLGNO14967 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLGNO14967 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLGNO14967 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLGNO14967 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLGNO14967 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLGNO14967 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLGNO14967 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms