Protein–RNA interactions for Protein: H3BS89

TMEM178B, Transmembrane protein 178B, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM178BH3BS89 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM178BH3BS89 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms