Protein–RNA interactions for Protein: E7EW58

LRRN3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3 (Fragment), humanhuman

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Length 273 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3E7EW58 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRN3E7EW58 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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