Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRRM5B3KS81 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms