Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SOBPA7XYQ1 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SOBPA7XYQ1 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
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