Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms