Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPDC1A2A3K4 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms