Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJA3Q9Y6H8 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GJA3Q9Y6H8 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GJA3Q9Y6H8 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GJA3Q9Y6H8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GJA3Q9Y6H8 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
GJA3Q9Y6H8 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
GJA3Q9Y6H8 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GJA3Q9Y6H8 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJA3Q9Y6H8 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJA3Q9Y6H8 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJA3Q9Y6H8 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJA3Q9Y6H8 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJA3Q9Y6H8 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJA3Q9Y6H8 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJA3Q9Y6H8 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms