Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D5

ARFGEF2, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF2Q9Y6D5 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARFGEF2Q9Y6D5 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARFGEF2Q9Y6D5 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARFGEF2Q9Y6D5 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARFGEF2Q9Y6D5 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARFGEF2Q9Y6D5 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARFGEF2Q9Y6D5 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARFGEF2Q9Y6D5 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ARFGEF2Q9Y6D5 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARFGEF2Q9Y6D5 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARFGEF2Q9Y6D5 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARFGEF2Q9Y6D5 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARFGEF2Q9Y6D5 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARFGEF2Q9Y6D5 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARFGEF2Q9Y6D5 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARFGEF2Q9Y6D5 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARFGEF2Q9Y6D5 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARFGEF2Q9Y6D5 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARFGEF2Q9Y6D5 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARFGEF2Q9Y6D5 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ARFGEF2Q9Y6D5 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARFGEF2Q9Y6D5 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARFGEF2Q9Y6D5 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARFGEF2Q9Y6D5 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARFGEF2Q9Y6D5 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARFGEF2Q9Y6D5 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ARFGEF2Q9Y6D5 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARFGEF2Q9Y6D5 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARFGEF2Q9Y6D5 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARFGEF2Q9Y6D5 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARFGEF2Q9Y6D5 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARFGEF2Q9Y6D5 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARFGEF2Q9Y6D5 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARFGEF2Q9Y6D5 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARFGEF2Q9Y6D5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARFGEF2Q9Y6D5 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ARFGEF2Q9Y6D5 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARFGEF2Q9Y6D5 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARFGEF2Q9Y6D5 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARFGEF2Q9Y6D5 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARFGEF2Q9Y6D5 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARFGEF2Q9Y6D5 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARFGEF2Q9Y6D5 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARFGEF2Q9Y6D5 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARFGEF2Q9Y6D5 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARFGEF2Q9Y6D5 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARFGEF2Q9Y6D5 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARFGEF2Q9Y6D5 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ARFGEF2Q9Y6D5 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ARFGEF2Q9Y6D5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARFGEF2Q9Y6D5 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARFGEF2Q9Y6D5 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARFGEF2Q9Y6D5 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARFGEF2Q9Y6D5 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARFGEF2Q9Y6D5 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARFGEF2Q9Y6D5 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARFGEF2Q9Y6D5 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
ARFGEF2Q9Y6D5 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARFGEF2Q9Y6D5 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARFGEF2Q9Y6D5 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
ARFGEF2Q9Y6D5 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
ARFGEF2Q9Y6D5 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARFGEF2Q9Y6D5 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARFGEF2Q9Y6D5 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARFGEF2Q9Y6D5 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARFGEF2Q9Y6D5 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARFGEF2Q9Y6D5 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARFGEF2Q9Y6D5 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARFGEF2Q9Y6D5 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARFGEF2Q9Y6D5 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARFGEF2Q9Y6D5 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARFGEF2Q9Y6D5 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ARFGEF2Q9Y6D5 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARFGEF2Q9Y6D5 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARFGEF2Q9Y6D5 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARFGEF2Q9Y6D5 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARFGEF2Q9Y6D5 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARFGEF2Q9Y6D5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARFGEF2Q9Y6D5 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARFGEF2Q9Y6D5 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARFGEF2Q9Y6D5 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ARFGEF2Q9Y6D5 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARFGEF2Q9Y6D5 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARFGEF2Q9Y6D5 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARFGEF2Q9Y6D5 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARFGEF2Q9Y6D5 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARFGEF2Q9Y6D5 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARFGEF2Q9Y6D5 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARFGEF2Q9Y6D5 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARFGEF2Q9Y6D5 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARFGEF2Q9Y6D5 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARFGEF2Q9Y6D5 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARFGEF2Q9Y6D5 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARFGEF2Q9Y6D5 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARFGEF2Q9Y6D5 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms