Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX8Q9Y5X2 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms