Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SH3BP1Q9Y3L3 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SH3BP1Q9Y3L3 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1Q9Y3L3 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1Q9Y3L3 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1Q9Y3L3 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1Q9Y3L3 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1Q9Y3L3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1Q9Y3L3 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1Q9Y3L3 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1Q9Y3L3 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1Q9Y3L3 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1Q9Y3L3 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1Q9Y3L3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1Q9Y3L3 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1Q9Y3L3 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1Q9Y3L3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1Q9Y3L3 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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SH3BP1Q9Y3L3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1Q9Y3L3 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1Q9Y3L3 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1Q9Y3L3 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1Q9Y3L3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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SH3BP1Q9Y3L3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SH3BP1Q9Y3L3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SH3BP1Q9Y3L3 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SH3BP1Q9Y3L3 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SH3BP1Q9Y3L3 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SH3BP1Q9Y3L3 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SH3BP1Q9Y3L3 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SH3BP1Q9Y3L3 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SH3BP1Q9Y3L3 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SH3BP1Q9Y3L3 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SH3BP1Q9Y3L3 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SH3BP1Q9Y3L3 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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SH3BP1Q9Y3L3 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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SH3BP1Q9Y3L3 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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SH3BP1Q9Y3L3 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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SH3BP1Q9Y3L3 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SH3BP1Q9Y3L3 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SH3BP1Q9Y3L3 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SH3BP1Q9Y3L3 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SH3BP1Q9Y3L3 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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SH3BP1Q9Y3L3 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SH3BP1Q9Y3L3 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SH3BP1Q9Y3L3 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SH3BP1Q9Y3L3 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SH3BP1Q9Y3L3 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SH3BP1Q9Y3L3 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SH3BP1Q9Y3L3 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SH3BP1Q9Y3L3 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
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