Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C4

TPRKB, EKC/KEOPS complex subunit TPRKB, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRKBQ9Y3C4 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TPRKBQ9Y3C4 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TPRKBQ9Y3C4 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TPRKBQ9Y3C4 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TPRKBQ9Y3C4 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TPRKBQ9Y3C4 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TPRKBQ9Y3C4 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TPRKBQ9Y3C4 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TPRKBQ9Y3C4 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TPRKBQ9Y3C4 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TPRKBQ9Y3C4 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TPRKBQ9Y3C4 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TPRKBQ9Y3C4 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TPRKBQ9Y3C4 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TPRKBQ9Y3C4 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPRKBQ9Y3C4 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPRKBQ9Y3C4 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPRKBQ9Y3C4 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPRKBQ9Y3C4 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPRKBQ9Y3C4 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPRKBQ9Y3C4 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPRKBQ9Y3C4 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPRKBQ9Y3C4 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPRKBQ9Y3C4 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPRKBQ9Y3C4 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPRKBQ9Y3C4 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPRKBQ9Y3C4 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPRKBQ9Y3C4 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPRKBQ9Y3C4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPRKBQ9Y3C4 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPRKBQ9Y3C4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPRKBQ9Y3C4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPRKBQ9Y3C4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TPRKBQ9Y3C4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPRKBQ9Y3C4 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPRKBQ9Y3C4 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPRKBQ9Y3C4 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPRKBQ9Y3C4 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms