Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms