Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SETD1BQ9UPS6 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SETD1BQ9UPS6 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SETD1BQ9UPS6 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SETD1BQ9UPS6 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SETD1BQ9UPS6 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SETD1BQ9UPS6 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SETD1BQ9UPS6 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SETD1BQ9UPS6 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SETD1BQ9UPS6 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SETD1BQ9UPS6 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SETD1BQ9UPS6 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SETD1BQ9UPS6 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SETD1BQ9UPS6 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SETD1BQ9UPS6 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SETD1BQ9UPS6 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SETD1BQ9UPS6 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SETD1BQ9UPS6 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SETD1BQ9UPS6 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SETD1BQ9UPS6 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SETD1BQ9UPS6 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SETD1BQ9UPS6 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SETD1BQ9UPS6 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SETD1BQ9UPS6 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SETD1BQ9UPS6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SETD1BQ9UPS6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SETD1BQ9UPS6 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SETD1BQ9UPS6 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SETD1BQ9UPS6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SETD1BQ9UPS6 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SETD1BQ9UPS6 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SETD1BQ9UPS6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SETD1BQ9UPS6 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms