Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV3

CIZ1, Cip1-interacting zinc finger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIZ1Q9ULV3 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms