Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG9

CROT, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROTQ9UKG9 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CROTQ9UKG9 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms