Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV7

MED13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13Q9UHV7 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MED13Q9UHV7 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms