Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLKQ9UBT6 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC24■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC24■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLKQ9UBT6 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms