Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms