Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
CCDC180Q9P1Z9 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC36.66■■■■□ 3.46
CCDC180Q9P1Z9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
CCDC180Q9P1Z9 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
CCDC180Q9P1Z9 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
CCDC180Q9P1Z9 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
CCDC180Q9P1Z9 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
CCDC180Q9P1Z9 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
CCDC180Q9P1Z9 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC36.65■■■■□ 3.46
CCDC180Q9P1Z9 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
CCDC180Q9P1Z9 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
CCDC180Q9P1Z9 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
CCDC180Q9P1Z9 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
CCDC180Q9P1Z9 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
CCDC180Q9P1Z9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
CCDC180Q9P1Z9 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
CCDC180Q9P1Z9 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
CCDC180Q9P1Z9 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
CCDC180Q9P1Z9 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
CCDC180Q9P1Z9 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
CCDC180Q9P1Z9 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
CCDC180Q9P1Z9 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
CCDC180Q9P1Z9 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
CCDC180Q9P1Z9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
CCDC180Q9P1Z9 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
CCDC180Q9P1Z9 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.46
CCDC180Q9P1Z9 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
CCDC180Q9P1Z9 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
CCDC180Q9P1Z9 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
CCDC180Q9P1Z9 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
CCDC180Q9P1Z9 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
CCDC180Q9P1Z9 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
CCDC180Q9P1Z9 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
CCDC180Q9P1Z9 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
CCDC180Q9P1Z9 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
CCDC180Q9P1Z9 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
CCDC180Q9P1Z9 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
CCDC180Q9P1Z9 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
CCDC180Q9P1Z9 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
CCDC180Q9P1Z9 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
CCDC180Q9P1Z9 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
CCDC180Q9P1Z9 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
CCDC180Q9P1Z9 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CCDC180Q9P1Z9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
CCDC180Q9P1Z9 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CCDC180Q9P1Z9 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CCDC180Q9P1Z9 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CCDC180Q9P1Z9 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
CCDC180Q9P1Z9 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CCDC180Q9P1Z9 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CCDC180Q9P1Z9 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CCDC180Q9P1Z9 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CCDC180Q9P1Z9 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CCDC180Q9P1Z9 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
CCDC180Q9P1Z9 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CCDC180Q9P1Z9 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC36.62■■■■□ 3.45
CCDC180Q9P1Z9 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CCDC180Q9P1Z9 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC36.61■■■■□ 3.45
CCDC180Q9P1Z9 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
CCDC180Q9P1Z9 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
CCDC180Q9P1Z9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
CCDC180Q9P1Z9 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
CCDC180Q9P1Z9 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
CCDC180Q9P1Z9 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC36.6■■■■□ 3.45
CCDC180Q9P1Z9 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
CCDC180Q9P1Z9 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
CCDC180Q9P1Z9 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
CCDC180Q9P1Z9 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
CCDC180Q9P1Z9 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
CCDC180Q9P1Z9 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
CCDC180Q9P1Z9 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
CCDC180Q9P1Z9 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
CCDC180Q9P1Z9 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
CCDC180Q9P1Z9 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
CCDC180Q9P1Z9 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
CCDC180Q9P1Z9 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
CCDC180Q9P1Z9 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
CCDC180Q9P1Z9 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
CCDC180Q9P1Z9 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
CCDC180Q9P1Z9 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
CCDC180Q9P1Z9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CCDC180Q9P1Z9 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CCDC180Q9P1Z9 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CCDC180Q9P1Z9 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
CCDC180Q9P1Z9 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CCDC180Q9P1Z9 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC36.59■■■■□ 3.45
CCDC180Q9P1Z9 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
CCDC180Q9P1Z9 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CCDC180Q9P1Z9 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
CCDC180Q9P1Z9 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
CCDC180Q9P1Z9 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
CCDC180Q9P1Z9 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
CCDC180Q9P1Z9 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CCDC180Q9P1Z9 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CCDC180Q9P1Z9 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC36.59■■■■□ 3.45
CCDC180Q9P1Z9 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CCDC180Q9P1Z9 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
CCDC180Q9P1Z9 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
CCDC180Q9P1Z9 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CCDC180Q9P1Z9 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms