Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR2

LRP1B, Low-density lipoprotein receptor-related protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 4,599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1BQ9NZR2 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LRP1BQ9NZR2 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms