Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZB2

FAM120A, Constitutive coactivator of PPAR-gamma-like protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM120AQ9NZB2 RRBP1-203ENST00000377807 3792 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.293e-10■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 ETV4-206ENST00000585508 760 ntTSL 520.74■□□□□ 0.911e-10■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.841e-10■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.811e-10■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.491e-10■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.481e-10■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 ETV4-210ENST00000590236 616 ntTSL 317.38■□□□□ 0.371e-10■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 ETV4-209ENST00000587151 582 ntTSL 515.29■□□□□ 0.041e-10■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.021e-10■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.021e-10■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.412e-7■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.032e-7■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 FAM129B-206ENST00000478917 362 ntTSL 515.05■□□□□ -02e-7■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.253e-15■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 DIDO1-204ENST00000370368 2704 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.13e-15■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 DIDO1-202ENST00000354665 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.23e-15■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 DIDO1-206ENST00000395340 7551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.813e-15■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 PFKL-207ENST00000474114 6007 ntTSL 1 (best)18.98■□□□□ 0.637e-8■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.112e-7■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.143e-7■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 CLIC4-202ENST00000488683 2723 ntTSL 213.44□□□□□ -0.263e-7■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.51e-18■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 GNAI2-206ENST00000446079 2086 ntTSL 1 (best)16.14■□□□□ 0.171e-18■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.131e-18■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 GNAI2-210ENST00000490122 2445 ntTSL 214.68□□□□□ -0.061e-18■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.061e-18■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 TOR1AIP2-203ENST00000482587 7067 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.29e-10■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.399e-10■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.038e-7■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 OSMR-203ENST00000508882 361 ntTSL 38.62□□□□□ -1.038e-7■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 OSMR-204ENST00000509237 653 ntTSL 56.36□□□□□ -1.398e-7■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.552e-7■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 PDE6D-205ENST00000486044 1005 ntTSL 218.07■□□□□ 0.482e-7■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.262e-7■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 PDE6D-203ENST00000428104 627 ntTSL 316.35■□□□□ 0.212e-7■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 PDE6D-204ENST00000477748 996 ntTSL 1 (best)15.3■□□□□ 0.042e-7■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 MZF1-AS1-203ENST00000600726 559 ntTSL 414.75□□□□□ -0.059e-7■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 MZF1-AS1-202ENST00000600534 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.169e-7■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 MZF1-AS1-201ENST00000593642 565 ntTSL 311.71□□□□□ -0.539e-7■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.277e-7■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.217e-7■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.157e-7■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.037e-7■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.987e-7■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 BID-206ENST00000473439 638 ntTSL 221.07■□□□□ 0.967e-7■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.937e-7■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 BID-208ENST00000550946 1394 ntTSL 1 (best)20.43■□□□□ 0.867e-7■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.837e-7■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 CARHSP1-204ENST00000562586 578 ntTSL 217.56■□□□□ 0.46e-8■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 BID-210ENST00000552886 330 ntTSL 315□□□□□ -0.017e-7■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.077e-7■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 BID-211ENST00000611040 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.327e-7■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 EIF2S3-201ENST00000253039 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.081e-19■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 RDH11-201ENST00000381346 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.816e-13■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.516e-13■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 AL049779.1-202ENST00000553582 498 ntTSL 25.22□□□□□ -1.576e-13■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 AL049779.1-203ENST00000554493 364 ntTSL 24.88□□□□□ -1.636e-13■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 AL049779.1-204ENST00000557564 274 ntAPPRIS P1 TSL 20.39□□□□□ -2.356e-13■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 RARA-208ENST00000577646 733 ntTSL 513.14□□□□□ -0.311e-6■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.712e-7■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 CARHSP1-210ENST00000567908 565 ntTSL 215.15■□□□□ 0.022e-7■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 BLCAP-213ENST00000467603 439 ntTSL 317.19■□□□□ 0.343e-7■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.12e-12■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.032e-12■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 TPM3-223ENST00000611659 3149 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.332e-12■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 TPM3-212ENST00000368533 3131 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.622e-12■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 TPM3-207ENST00000341372 2007 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.662e-12■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 TPM3-215ENST00000469717 4041 ntTSL 28.75□□□□□ -1.012e-12■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.831e-6■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.161e-7■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.061e-7■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.041e-7■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 PEG3-201ENST00000326441 8723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.91e-7■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 EEF1D-217ENST00000526786 1246 ntTSL 224.73■■□□□ 1.555e-10■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 EEF1D-241ENST00000531931 614 ntTSL 324.73■■□□□ 1.555e-10■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.535e-10■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.495e-10■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 EEF1D-212ENST00000525695 907 ntTSL 524.2■■□□□ 1.465e-10■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.345e-10■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.085e-10■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.025e-10■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 EEF1D-235ENST00000530848 688 ntTSL 321.02■□□□□ 0.965e-10■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.855e-10■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.825e-10■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 EEF1D-249ENST00000533749 633 ntTSL 518.99■□□□□ 0.635e-10■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.635e-10■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 EEF1D-206ENST00000524397 957 ntTSL 318.73■□□□□ 0.595e-10■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 EEF1D-224ENST00000529007 861 ntTSL 218.73■□□□□ 0.595e-10■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.595e-10■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.545e-10■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 EEF1D-250ENST00000533833 831 ntTSL 518.12■□□□□ 0.495e-10■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 EEF1D-244ENST00000532543 791 ntTSL 318.11■□□□□ 0.496e-10■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.375e-10■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 EEF1D-230ENST00000530191 853 ntTSL 316.72■□□□□ 0.275e-10■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 EEF1D-252ENST00000534377 617 ntTSL 216.14■□□□□ 0.175e-10■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 EEF1D-251ENST00000534232 817 ntTSL 516.11■□□□□ 0.175e-10■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.095e-10■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 EEF1D-247ENST00000533204 842 ntTSL 214.9□□□□□ -0.025e-10■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 EEF1D-236ENST00000531218 787 ntTSL 314.68□□□□□ -0.065e-10■■□□□ 14
FAM120AQ9NZB2 EEF1D-215ENST00000526340 770 ntTSL 314.68□□□□□ -0.065e-10■■□□□ 14
Retrieved 100 of 20,049 protein–RNA pairs in 394.2 ms