Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms