Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKDREJQ9NTG1 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms