Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ABCC13Q9NSE7 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ABCC13Q9NSE7 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms