Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV8

PRDM8, PR domain zinc finger protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM8Q9NQV8 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRDM8Q9NQV8 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRDM8Q9NQV8 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRDM8Q9NQV8 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRDM8Q9NQV8 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRDM8Q9NQV8 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRDM8Q9NQV8 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRDM8Q9NQV8 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PRDM8Q9NQV8 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRDM8Q9NQV8 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRDM8Q9NQV8 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRDM8Q9NQV8 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRDM8Q9NQV8 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRDM8Q9NQV8 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRDM8Q9NQV8 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRDM8Q9NQV8 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRDM8Q9NQV8 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRDM8Q9NQV8 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRDM8Q9NQV8 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRDM8Q9NQV8 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PRDM8Q9NQV8 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRDM8Q9NQV8 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRDM8Q9NQV8 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRDM8Q9NQV8 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRDM8Q9NQV8 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PRDM8Q9NQV8 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRDM8Q9NQV8 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRDM8Q9NQV8 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRDM8Q9NQV8 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRDM8Q9NQV8 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRDM8Q9NQV8 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRDM8Q9NQV8 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRDM8Q9NQV8 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRDM8Q9NQV8 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRDM8Q9NQV8 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRDM8Q9NQV8 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRDM8Q9NQV8 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRDM8Q9NQV8 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRDM8Q9NQV8 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRDM8Q9NQV8 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRDM8Q9NQV8 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRDM8Q9NQV8 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRDM8Q9NQV8 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRDM8Q9NQV8 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRDM8Q9NQV8 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRDM8Q9NQV8 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRDM8Q9NQV8 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRDM8Q9NQV8 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRDM8Q9NQV8 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRDM8Q9NQV8 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRDM8Q9NQV8 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRDM8Q9NQV8 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRDM8Q9NQV8 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRDM8Q9NQV8 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PRDM8Q9NQV8 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRDM8Q9NQV8 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRDM8Q9NQV8 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRDM8Q9NQV8 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRDM8Q9NQV8 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRDM8Q9NQV8 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRDM8Q9NQV8 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRDM8Q9NQV8 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRDM8Q9NQV8 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRDM8Q9NQV8 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRDM8Q9NQV8 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRDM8Q9NQV8 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRDM8Q9NQV8 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRDM8Q9NQV8 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRDM8Q9NQV8 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRDM8Q9NQV8 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRDM8Q9NQV8 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRDM8Q9NQV8 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRDM8Q9NQV8 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRDM8Q9NQV8 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRDM8Q9NQV8 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRDM8Q9NQV8 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRDM8Q9NQV8 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRDM8Q9NQV8 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRDM8Q9NQV8 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRDM8Q9NQV8 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRDM8Q9NQV8 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRDM8Q9NQV8 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRDM8Q9NQV8 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRDM8Q9NQV8 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRDM8Q9NQV8 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRDM8Q9NQV8 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRDM8Q9NQV8 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms