Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms