Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SEMA4BQ9NPR2 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms