Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FANCFQ9NPI8 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FANCFQ9NPI8 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
FANCFQ9NPI8 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FANCFQ9NPI8 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FANCFQ9NPI8 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
FANCFQ9NPI8 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FANCFQ9NPI8 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FANCFQ9NPI8 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FANCFQ9NPI8 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FANCFQ9NPI8 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FANCFQ9NPI8 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FANCFQ9NPI8 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FANCFQ9NPI8 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FANCFQ9NPI8 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FANCFQ9NPI8 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FANCFQ9NPI8 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FANCFQ9NPI8 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FANCFQ9NPI8 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FANCFQ9NPI8 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
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