Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU5

NYX, Nyctalopin, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NYXQ9GZU5 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NYXQ9GZU5 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NYXQ9GZU5 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NYXQ9GZU5 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NYXQ9GZU5 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NYXQ9GZU5 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
NYXQ9GZU5 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NYXQ9GZU5 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NYXQ9GZU5 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NYXQ9GZU5 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NYXQ9GZU5 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NYXQ9GZU5 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NYXQ9GZU5 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NYXQ9GZU5 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NYXQ9GZU5 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NYXQ9GZU5 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NYXQ9GZU5 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NYXQ9GZU5 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NYXQ9GZU5 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NYXQ9GZU5 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NYXQ9GZU5 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NYXQ9GZU5 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NYXQ9GZU5 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NYXQ9GZU5 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NYXQ9GZU5 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NYXQ9GZU5 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NYXQ9GZU5 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NYXQ9GZU5 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NYXQ9GZU5 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NYXQ9GZU5 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NYXQ9GZU5 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NYXQ9GZU5 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NYXQ9GZU5 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NYXQ9GZU5 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NYXQ9GZU5 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NYXQ9GZU5 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NYXQ9GZU5 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NYXQ9GZU5 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NYXQ9GZU5 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NYXQ9GZU5 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NYXQ9GZU5 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NYXQ9GZU5 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NYXQ9GZU5 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NYXQ9GZU5 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NYXQ9GZU5 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NYXQ9GZU5 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NYXQ9GZU5 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NYXQ9GZU5 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NYXQ9GZU5 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NYXQ9GZU5 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NYXQ9GZU5 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NYXQ9GZU5 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NYXQ9GZU5 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NYXQ9GZU5 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NYXQ9GZU5 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NYXQ9GZU5 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NYXQ9GZU5 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NYXQ9GZU5 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NYXQ9GZU5 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NYXQ9GZU5 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NYXQ9GZU5 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NYXQ9GZU5 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NYXQ9GZU5 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms