Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDGFDQ9GZP0 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDGFDQ9GZP0 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms