Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRCC1Q9C099 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms