Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
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FOXQ1Q9C009 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
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FOXQ1Q9C009 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
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FOXQ1Q9C009 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
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FOXQ1Q9C009 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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FOXQ1Q9C009 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXQ1Q9C009 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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