Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms