Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GSDMCQ9BYG8 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms