Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCAPERQ9BY12 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms