Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRRTQ9BXP5 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms