Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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