Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FYCO1Q9BQS8 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FYCO1Q9BQS8 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms