Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms