Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MYD88Q99836 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms