Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms