Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms