Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALS2Q96Q42 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALS2Q96Q42 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms