Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 AL117339.1-201ENST00000419779 428 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 AL157385.1-201ENST00000446973 268 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 PLSCR5-202ENST00000482567 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 PMP2-202ENST00000519260 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 AC023908.1-201ENST00000559899 567 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 Z98949.1-213ENST00000608921 856 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 OR4B1-201ENST00000309562 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 AL512637.1-201ENST00000439523 1231 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 AC087273.2-201ENST00000519038 634 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 CARD8-211ENST00000519332 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 CARD8-224ENST00000522431 622 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 FAM228B-205ENST00000611127 975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 AC243960.7-201ENST00000623532 707 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 COA4-201ENST00000355693 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 AL035587.1-202ENST00000607218 984 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms