Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RNF185Q96GF1 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms