Protein–RNA interactions for Protein: Q96CJ1

EAF2, ELL-associated factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF2Q96CJ1 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EAF2Q96CJ1 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms