Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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TRIM63Q969Q1 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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TRIM63Q969Q1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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TRIM63Q969Q1 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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TRIM63Q969Q1 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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TRIM63Q969Q1 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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TRIM63Q969Q1 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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TRIM63Q969Q1 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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TRIM63Q969Q1 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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