Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RGP1Q92546 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms