Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms